Bioinformaticien

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Description de l'entreprise

Au sein du Groupe EUROFINS (4,56 milliards d’euros de chiffre d’affaires, plus de 800 laboratoires répartis dans 50 pays et environ 47000 personnes), l’un des leaders mondiaux sur le marché des services bio-analytiques, la division ‘‘Clinical Diagnostics’’ contribue au bien-être et à la santé de tous en fournissant à ses clients des services d'analyse et de conseil de haute qualité.

Eurofins Biomnis, leader européen de la biologie médicale spécialisée, est issu du laboratoire créé par Marcel Mérieux en 1897, et a rejoint le groupe Eurofins en 2015.

Eurofins Biomnis défend une conception de la biologie spécialisée entièrement tournée vers l’excellence, l’innovation et l’investissement technologique. Fort de ses 2 500 examens disponibles, le laboratoire Eurofins Biomnis a fondé sa réputation sur le développement continu de nouveaux tests et la réalisation d’analyses à forte valeur ajoutée médicale.

Dans le cadre de la crise sanitaire actuelle, le groupe Eurofins a développé l’une des offres analytiques et de services les plus complètes actuellement disponible, en mobilisant toutes ses capacités techniques et scientifiques à travers son réseau mondial.

Le Laboratoire de Biologie spécialisée Eurofins Biomnis est tout naturellement un acteur clé dans la gestion de la crise COVID-19 par sa structure, son expertise, et ses talents.

Description du poste

Dans un contexte de forts enjeux et dans le cadre du déploiement de notre activité, notamment de séquençage, nous recherchons un CDD de 6 mois pour notre service de bioinformatique un(e) BIOINFORMATICIEN CLINIQUE H/F.

En collaboration avec les autres bioinformaticiens du laboratoire, vos missions seront les suivantes :

 ·         Assurer le bon déroulement des pipelines d’analyses de production, de la récupération des données brutes à la livraison des résultats aux cliniciens et porteurs de projets dans le cadre des activités de diagnostic et de recherche ;

·         Participer à la maintenance et au développement des outils bioinformatiques ;

·         Participer à la conception, au développement et à l’optimisation de l’architecture informatique permettant le calcul intensif et le stockage des données ;

·         Mettre en place et/ou adapter les procédures bio-informatiques d’analyse des données dans le contexte de la norme ISO 15189 ;

·         Assurer le recueil et la spécification des besoins pour l’activité de diagnostic clinique ;

·         Evaluer les outils bio-informatiques existants et apporter des nouvelles solutions pour l’analyse de données, notamment de de séquençage.

Qualifications

De Formation Bac+3 à Bac+5 en Bioinformatique, vous disposez de connaissance en biologie moléculaire et en analyse de données de séquençage haut-débit (NGS).

La maitrise d’un langage de programmation (R, Python ou Java) et d’un interprétateur de commandes (Bash/Shell) est indispensable. La maitrise du gestionnaire de workflow Nextlow sera appréciée.

Des connaissances en séquençage Illumina ou en administration de serveurs Unix seront fortement appréciées.

Doté d'un fort esprit d'analyse et de synthèse, vous êtes reconnu(e) pour votre rigueur et votre organisation. Vous êtes force de proposition, vous savez travailler en autonomie et vous intégrer dans une équipe pluridisciplinaire.

Votre capacité à collaborer, votre esprit d’équipe et votre sens du relationnel seront des atouts appréciés.

La maitrise de l’anglais serait un plus.

Informations complémentaires

Lieu de travail : Lyon 7ème 

CDD à pourvoir rapidement pour une durée de 6 mois à temps plein 

Statut cadre

Rémunération : salaire brut annuel selon expérience

Nombreux avantages :

26 jours de congés payés, 13 Jours de RTT

Participation et intéressement

Restaurant d’entreprise

Politique de confidentialité