Programmeur R (H/F), CDD 18 mois

  • Temps complet

Description de l'entreprise

Epicentre est une organisation créée par Médecins Sans Frontières (MSF) en 1986. Nous menons des activités d’épidémiologie de terrain, de formation et de recherche pour les interventions MSF. Nos activités auprès des populations en situation précaire sont menées depuis l'Ouganda, le Niger et la France, et sur des programmes MSF et autres. Elles concernent essentiellement les maladies infectieuses et la dénutrition.

Description du poste

Contexte

Epicentre utilise de plus en plus le langage de programmation R pour gérer tous les aspects de ses processus de données, y compris l'acquisition, le nettoyage, la modélisation, la visualisation et la rédaction de rapport. Ce poste vise à accroître nos capacités internes à répondre aux exigences techniques de plusieurs essais cliniques : en République Démocratique du Congo sur un vaccin Ebola, au Niger sur des études de notre centre de recherche, et sur une étude de cohorte multi-pays sur la fièvre de Lassa. Au sein de l'équipe Analyse et Visualisation, intégrée dans le département Recherche, les principales tâches du programmeur R seront :

Activités principales

-          Sous la supervision de l’équipe permanente, aider à l'élaboration du plan de gestion des données et la génération de rapports ;

-          Programmer des outils ETL (Extraction, transformation et chargement) sous forme de scripts et packages R pour automatiser les tâches suivantes:

o   Extraire les données des formulaires de rapport de cas (CRF) 

o   Appliquer les normes de qualité et de consistance

o   Réconcilier et fusionner des données provenant de sources disparates

o   Mettre les données sous forme de bases relationnelles ordonnées, aptes à l'analyse et à la visualisation.

-          Aider au développement de rapports de données automatisés à l'aide de Rmarkdown ;

-          Aider à l'élaboration de tableaux de bord de surveillance interactifs à l'aide de R Shiny ;

-          Documenter clairement les détails techniques de votre travail pour faciliter la collaboration avec les autres membres de l'équipe et assurer le contrôle de la qualité ;

-          Agir en tant qu'expert technique auprès des équipes de saisie de données sur le terrain et être en mesure de répondre aux demandes de données ad hoc des intervenants du projet ;

-          Implémenter en R des analyses précédemment effectuées dans des logiciels moins adaptés (ie. Excel).

Qualifications

·       Licence ou master en informatique, biostatistique, ou autre diplôme avec une forte composante quantitative appliquée ;

·       1 à 5 ans d'expérience pertinente. Expérience en sciences des données en santé publique fortement souhaitée ;

·       Excellente maîtrise de la programmation R avec la suite de packages Tidyverse (obligatoire), développement et maintenance de packages R (obligatoire), développement d'applications Web avec R Shiny (préférable) et expérience des bases de données SQL (préférable) ;

·       Expérience de collaboration sur des projets informatiques utilisant le contrôle de version distribué (Git) ;

·       Expérience du travail et de la gestion de grands ensembles de données, y compris la fusion d'ensembles de données disparates, le nettoyage et la transformation des données, et la fourniture de statistiques descriptives préliminaires ;

·       Appréciation des principes fondamentaux d'une visualisation efficace des données ;

·       Excellentes aptitudes à la communication écrite et verbale ;

·       GitHub portfolio ou autres exemples de codes accessibles souhaités ;

·       Français, l'anglais : lu, écrit, parlé.

Informations complémentaires

Conditions

-        Poste basé à Paris, CDD de 18 mois. Déplacements possibles.

-        Prise de poste : dès que possible

-        Rémunération : 41,6K€ annuels bruts sur 13 mois, 22 jours de RTT, complémentaire santé, remboursement de 50% du pass navigo, titres déjeuner.

Politique de confidentialité